Le jeune Will, à la recherche de son père disparu depuis de longues années, croit avoir tué un homme. Dans sa fuite, il franchit la brèche qui lui permet de passer dans un monde parallèle. Là, à Cittàgazze, la ville au-delà de l'Aurore, il rencontre Lyra. Les deux enfants devront lutter contre les forces obscures du mal et, pour accomplir leur quête, pénétrer dans la mystérieuse Tour des Anges...
Un nouveau plan machiavélique pour tuer Koro sensei se prépare dans la classe E : se basant sur l'hypothèse que leur professeur n'est pas forcément à l'aise dans l'eau, les élèves veulent profiter de cette faiblesse pour tenter une nouvelle fois de l'achever. Cette nouvelle stratégie est menée de main de maître par Kataoka, qui est bien trop douée par être arrivée dans la classe par hasard . quel secret cache-t-elle donc ?